Kafka Hibino, um jovem que deseja entrar para a Força de Defesa contra Kaijus após uma tragédia pessoal. Ao lado de Mina Ashiro, sua amiga de infância, Kafka tenta entrar para o grupo, mas, pela falta de força física, filha. Contudo, ele recebe a habilidade de virar um kaiju e lutar contra as criaturas gigantes por conta própria.